侯马海关是国家设在侯马的进出境监督管理机关，隶属于太原海关，主要负责临汾、运城、晋城三市的进出境货物、物品和运输工具的监督管理，征收关税和其它税费，查缉走私以及编制海关统计等工作任务。主要职责是：负责受理进出口货物报关审核、征收税费和查验放行；受理退、补税申请及转报；负责辖区内进口货物减免税（包括特定减免税货物、捐赠物资、常驻机构和人员办公用品及自用物品）审批管理工作；负责受理辖区内运输企业承运海关监管货物的申请审批；受理在辖区内设立海关监管仓库、保税工厂、公共型保税仓库及其它海关监管场所的申请初审、转报并办理注册备案、年审手续；负责办理辖区内外汇核销IC卡的申请、审核、转报、发放、年审工作；负责接受企业担保、预归类及转报；负责辖区内出口退税联、出口结汇、进口付汇专用联及其它进出口报关单证的实际签发；负责对辖区内各类海关监管场所、运输工具进行实际监管；负责办理转关运输审批手续及进口货物转关准单回执核销；负责辖区内专业和代理报关企业开办申请的受理和转报，办理自理报关企业、报关员注册、审批备案和年审工作；受理辖区内加工贸易手册的审批备案、中期核查及核销工作；办理保税料件的异地结转（调拨）监管手续；负责辖区内涉嫌走私、违规案件的调查及查获案件的移交工作；负责及时分析本关进出口商品动态，组织开展涉税商品的价格跟踪及企业稽查工作。