大理海关于1995年5月12日经国务院批准设立，同年11月22日开关，隶属于昆明海关，负责大理白族自治州、迪庆藏族自治州进出境运输工具、货物、物品的海关监管、征税、统计、调查业务。1996年2月8日，大理海关驻大理古城邮政分局监管点挂牌，对外开展进出境邮递物品的海关监管业务。
大理海关地处云南省大理市下关镇，是我省目前唯一一个内陆海关，所有进出口货物均需办理转关运输手续，为此，我们充分发挥转关运输可减少进出口货物在口岸积压时间、提高通关效率、降低贸易成本等优势，积极扶持企业开展进出口业务。开关近七年来，我们一贯坚持想企业之所想、急企业之所急，把企业的困难当作自己的困难，积极、主动、热情地为企业提供优质、高效服务的指导思想。在今后的工作中，我们将一如既往地坚持自己的指导思想，为地方外向型经济的发展贡献力量。
大理海关目前的管理模式为：办公大楼内办理进出口企业备案，进出口货物现场接单审核、征税、查验、放行、转关运输、进出口结关、统计以及调查、稽查等业务；在大理市凤仪镇火车货运站不定期派员监管进出口货物；在大理古城邮政分局监管点派员在工作日和节假日值班，办理海内外客商、旅游者、个人进出境物品、货样等邮递物品的海关手续。
