海关方面称，进口货物若想享受CEPA下的“零关税”，必须凭符合规定的原产地证书。香港原产地证书的发证机构为香港特别行政区政府工业贸易署和香港中华总商会、香港印度商会、香港工业总会、香港总商会、香港中华厂商联合会。澳门原产地证书的发证机构为澳门经济局。

原产地证书的签发要求包括有：原产地证书上具有唯一的编号；一份原产地证书只能对应一批同时进入内地的货物。一份原产地证书可包括不多于5项8位数级税目的货物，而这些税目的货物必须同属于CEPA下的零关税货物；原产地证书上列明指定的单一到货口岸；原产地证书的产品采用内地协调制度编号，按适用的《中华人民共和国海关进出口税则》8位数级税号填写；原产地证书的计量单位，按适用的实际成交的计量单位填写；原产地证书的有效期为自签发日起120天。