全国各直属海关都设立了法规处（室），具体负责本关区的知识产权边境保护工作，权利人发现侵权嫌疑货物即将进出口的，可以直接向货物进出境地的直属海关法规处（室）提出采取保护措施的申请。
各基层海关的审单、查验部门的广大海关官员，直接参予了对侵权货物的监控、查验等工作。
在进出口侵权货物比较集中的基层海关，比如深圳、上海、南宁等关区的基层海关，还设立了法规科或知识产权边境保护工作联络员，具体实施或指导本关的知识产权保护工作。
