实施通关单联网核查后，出入境检验检疫部门将通关单电子数据传输到海关，海关比对通关单内容验放商品。如果系统提示“海关未能正常核销”或“通关单已过期”等异常信息，海关会向企业退单或要求企业改单。如果通关手续顺利完成，海关将把通关单使用情况反馈质检总局。