汕头保税区海关在通关各环节上缩短时间，提高效率，为诚信守法企业构建一条快速通关干道。首先，24小时预约监管和5＋2工作制度实现了全天候和节假日无休通关。企业只要提前预约，可以在非正常上班时间和节假日办理通关手续。其次，对于信誉良好的守法企业，经企业申请，该关给企业的进出口货物提供了预归类、预审价的便利，将通关环节前推后移，缩短通关时间。第三，在查验工作上，该关以非侵入式查验方式为主，降低开箱查验率。对一些不宜在监管现场开箱和查验的货物，经企业提出申请，该关派人到企业查验，提高查验效率，为企业提供方便。该关承诺，对出口货物，除发现走私、违规嫌疑或有其他问题必须扣货调查、处理的以外，如单证完备、情况正常的，2小时内办结验放手续；对进口货物，情况正常、无需开验和纳税的，自货物申报之日起1个工作日内办结验放手续。

汕头保税区海关特事特办，为进出口企业提供通关便利，帮助企业节约经营成本。对海运进口的单一、大宗货物，实现“提前申报、实货放行”。在船舶离开装货港后，船舶代理人提前录入并向海关传送仓单电子数据，海关提前确认，企业可以提前办结申报纳税手续，在船舶抵港后，海关对货物进行实货确认放行，减少船舶滞港时间，为企业节约成本。企业进出口属于鲜活类产品、油汽类商品、危险品的，也享受了“提前报关、实货放行”的通关便利，避免企业造成损失。企业进口的应税货物，如因必须通过送检、商检等方式才能确定完税价格、适用税率的，或有海关认可的特殊原因需要税前验放的，企业可以凭银行税前验放保函等担保形式向该关提出申请。

汕头保税区海关积极支持关区企业开展加工贸易和物流配送业务。在准入领域上，该关坚持“非禁即准”的非歧视原则。加工贸易货物实际进出口时，料件与成品的规格型号、价格、原产地变更的，在品名相同、不影响单耗管理的条件下，可以先予放行，事后再补办变更手续。对区内企业向区外外贸公司购进原料的，实行进区报关、货物实际离境时开出退税联和出境备案清单的管理模式，便于区外外贸公司向国税部门申请退税。保税区企业与区外企业间开展深加工结转业务，属区内企业信誉良好、区外企业为汕头关区内的企业且结转商品为非重点敏感商品的，企业可采用事先备案、收发货进出区登记、每月定时集中报关的形式进行办理。仓储企业开展物流配送业务，对区外进区的货物采用每票报关的形式，对区内复出区外货物，若企业仓储及物流实行计算机管理、内部管理规范、信誉良好的，允许企业一次报关分批送货，并逐批办理海关登记和核扣手续。