据《珠海特区报》报道，２００６是我国入世的５年过渡期，面临关税税率进一步下调的形势，拱北海关改革创新，采取多种措施实现科学管理，通过提高自身执法水平，提高通关效率和服务质量，吸引更多的企业从拱北海关进口货物，增加税源。据统计，２００６年拱北海关关区进口货物总值达１９８．８亿美元，同比增长１７％，其中进口应税货物货值达３９．５亿美元，主要进口商品为化工品、燃料油、废五金等。

拱北海关编写的《通关事务规范标准化操作手册》，统一了各口岸关税业务操作，同时公布了限时办事制度，该关首创并自行研发的“加工贸易边角料电子样品库”，实现了业务操作电子化和网络化，以上举措大大提高了海关征税工作效率和准确率。目前，该系统已汇集了１８００多家企业的近３８００张图片，海关可根据图片资料的状态进行估价和归类，有效促进了加工贸易内销征税大幅度增长，全年仅该项就征税２．６亿元人民币，同比增长６２．５％，成为拱北关区税收增长的新亮点。