据海关方面分析，新办法的实施主要有三个变化：一是自2006年2月1日起，组织药材进口，申请人应当在取得《进口药材批件》后，向相关部门提出登记备案申请；二是海关仍凭《进口药品通关单》，验放进口列入《进口药品目录》商品编码范围的药材，但《进口药品通关单》仅限在该单上注明的口岸海关使用，并实行一批一证制度，证面内容不得更改，如需更改，须换发新证；三是自2006年1月1日起，对《进口药品目录》进行调整，增加部分商品编码。