为加大泛珠三角区域水运监管改革力度和网络建设，提高广西企业面向粤港澳的经济竞争力，梧州海关作为试点，将于下半年实施目前广州海关已使用的来往港澳小型船舶快速通关模式（简称“小船快通系统”），梧州试点成功后，该系统将在泛珠三角区域内的其他地方推广。 据统计，西江航道上的货运船舶，绝大部分属于小型船舶，但又几乎支撑着整个西江流域的对外贸易运输。这些船舶装载的货物品种繁多，往往一艘船上就装载有十几单不同的进出口货物。当船舶从港澳载货驶往处于内地的各口岸时，按以往的规定，中途监管的海关经常需要发出停船检查的指令，使船舶的通航时间延长而增加成本，在与沿海发达地区船舶的竞争中处于不利地位。
海关启用“小船快通系统”后，将对所有辖区内的进出境船舶实施分级监管制度，利用全球卫星定位系统（GPS）技术和地理信息技术、微控技术，对该类船舶的行驶路线和行驶状态实施全程动态监控，基本杜绝了船只中途非法装卸货物的可能。由此，合法航行在西江流域的梧州船只，再也无须中途停船接受其他海关的检查，可以享受直接航行到目的地，大大缩短了航运的时间，简化了手续，提高了航运效率。对于梧州的航运业，这是以科技带动产业升级的一项新改革。
该系统通过GPS技术与互联网络技术的结合，沿江各海关和船务公司都可以由公共网络平台实现船舶信息的数据共享，实现预录入舱单，自动完成向海关申报、海关直接进行风险分析等多种功能。因此，在梧州口岸开展进出口业务的企业，可以在货物尚在运输途中时就提前报关，从而缩短了通关时间。此举既加强了西江流域对外贸易运输的信息化水平，又使梧州市的进出口更快捷，营造与周边地区的大通关环境起到良好的推动作用。
目前，在泛珠三角区域合作的十项措施中，“来往港澳小船快通系统”是唯一由梧州海关试点推广的项目。该项目的成功应用推广，将加强梧州与其他泛珠三角区域城市的合作，在相当程度上推动梧州成为西江流域进出口贸易的物流枢纽，带动和促进梧州外向型经济及航运业的发展。
