针对农产品需要快速通关的特点，福州海关为台湾进口农产品设立了专门的快速通关通道和窗口，允许海运进口台湾农产品提前报关，使进口台湾农产品货物做到“零滞港”；同时还启动了“就近报关、口岸验放”通关模式，内地或山区企业进口的台湾农产品，可以选择内陆海关就近报关、由口岸海关进行验放；对山区企业进口的台湾农产品在转关运输时还可以选择“一次申报、一次查验、一次放行”通关模式，以保证农产品新鲜。

　　厦门港目前正在争取成为台湾农产品直接进入大陆的中转基地。厦门积极开辟“绿色通道”，设立台湾水果的专用港，对台湾农产品在大陆销售所涉及的通关、检验检疫、物流等方面也将实施优惠便利措施。厦门海关还将启动全天候通关模式，从厦门登陆的台湾农产品的通关将实现“零等待”。