植物输入韩国的检疫程序，大致分为下列几个步骤：

　　(一)输入植物业者申请检查，先审查文件，再进行现场检验；

　　(二)按输入植物品类，分为：输入禁止植物和非输入禁止植物，禁止植物则废弃或退回，非禁止植物则进行检查。检查结果若发现非检疫病害虫或未发现病害虫，即可颁发合格证。

　　(三)实验室检查，依检查结果视能否鑒定病害虫分类，来决定风险评估和检疫方案。

　　(四)根据检疫方案与病害虫发现情形，是否可能消毒处理，若不能消毒处理，则废弃或退回，若可消毒处理，在确认消毒结果病害虫已扑灭后，就可颁发合格证。

　　二、植物检疫程序之相关重要法规

　　(一)输入植物的检查义务（植物防疫法第9条）

　　输入植物或其容器、包装（以下均称“植物等”）及禁止品者应及时到国立植物检疫机关长申报并接受审查。

　　(二)免检植物

　　1.不拘以上规定，以下植物可免检：

　　 经化学药品、盐、糖、油或其它具防腐效果的物质进行过防腐处理的；

　　 不需加工也可使用的木制或竹制品；

　　 加工成绵、麻布、纸、绳或网等纤维制品形态；

　　 消灭有害动物及有害植物（病害虫），以免病害虫再次侵入的包装；

　　 加工成其它病害虫不可栖息的植物；

　　2.国立植物检疫所长告示有关免检的品目例示

　　(三)检疫证明附加规定（植物防疫法第6条第1项）

　　输入的植物如果没有输出国政府机关颁发的检疫证明书或其复本（必须与原本一样，且要有发行人或检疫负责人的亲自签名或盖章证明书），证明已经检查确定无限制病害虫，就不得输入。

　　(四)不需附加检疫证明也可输入的植物(植物防疫法第6条第一项附文及同施行规则第6条)

　　不拘以上检疫证明附加条件，以下不需附加检疫证明：

　　 从无相关植物检疫政府机关的国家输入之植物

　　 随身携带输入的植物

　　 以邮政方式输入的植物

　　 木材类及竹类

　　 用于实验研究的植物及病害虫

　　 种植用或栽植用无外汇进口植物

　　 海关以拍卖的形式处理的植物

　　 符合植物检疫所长的告示标准，以高温、干化、粉碎、压缩或冷冻处理，以及其它密封包装方法加工的植物

　　 附着输出国政府机关或公共检查机关发行的品质及状态说明书（Certificateof Qualityand Condition）等证明书，说明其植物（限于非输入禁止植物）已完成至零下17.8℃以下的冷冻处理，可维持冷冻状态的事实。

　　 附加输出国检疫机关发行的出口证明书(Export Certificate)的以下植物：棉花皮及大豆皮的pellet、豆饼、去壳后真空包装的干果类、紫花苜蓿干草、麦芽等谷类的麦芽膏。

　　(五)输入禁止品（植物防疫法第7条）

　　经过有关病害虫风险分析之评估结果，认为一旦流入国内就会带来巨大损失的这一病害虫分布地区，其所生产的植物和经过该地区的植物（植物防疫法施行规则另表1）

　　有害动物或有害植物

　　土壤或附着土壤的植物

　　以上植物或物品的容器、包装

　　(六)不属输入禁止品的植物（输入植物检疫要领第6条）

　　附具输出国发行的证明冷冻处理到零下17.8℃（0℉）以下的植物检疫证明或公共检查机关证明书的冷冻植物，确能维持其冷冻状态，就不视为输入禁止品。但，植物防疫法施行规则另表1输入禁止植物第7号的马铃薯和茄科植物活的茎、叶及活植物的地下部分，即使经过冷冻处理也视为输入禁止品。

　　(七)隔离栽培对象植物（植物防疫法施行规则第15条第1项）

　　花卉的球根类

　　马铃薯的块茎及红薯的块根

　　果树类及果树的苗木、接穗和插穗

　　输入禁止品中经输入许可用于实验研究中栽植或繁殖的苗木

　　草莓苗

　　(八)免隔离栽培植物（植物防疫法施行规则第15条第2项及植物检疫告示第96-9号第4条）

　　输入后不栽培直接输出的种苗

　　不以贩卖为目的的100株以下的球根类

　　不以贩卖为目的的10株以下呈树形的盆栽果树及盆栽果树苗

　　与输出国签订不进行隔离栽培协议的种苗

　　(九)颁发检查合格证（植物防疫法第10条第4项）

　　输入检查结果符合附加检疫证规定、暂时限制输入规定、产地内检查、消毒处理规定、禁品规定，并认定无限制病害虫及暂定限制病害虫时

　　(十)消毒、废弃等处理（植物防疫法第10条第1项-第3项，输出入植物检疫所处理标准：植物检疫告示第96-4号第2章）

　　无输出国发出的检疫证明书或属暂时输入限制产品、输入禁止品时：废弃或退回

　　检查结果如发现禁止害虫时：废弃或退回