东莞是中国内地加工贸易经营的密集地，涉及外资企业近二万家。据东莞海关的有关通报称，多数从事加工贸易企业能守法经营，自觉纳税。但也有部分企业擅自对内销售保税料件或设备、低报内销价格，屡屡发生高报单耗、截留料件进行倒卖的违法事件。仅去年被上级海关查获加工贸易渠道的走私犯罪案件就有六十多起，案值逾二十亿元人民币，严重扰乱正常的对外经营秩序。

　　据了解，东莞许多外企自九月一日开始对二00三年以来加工贸易的自查补税，多数能按照海关要求“二十六条”的内容进行。但在申报补税的过程中，也存在对进口物料品类、原材料成本及损耗等应缴税项的争议。如部分港商提出进口物料的实际损耗量与海关核定的损害量存在差异；台商协会也就台资企业遇到的相关自查问题，书面征询了海关，这些都得到了海关依据有关法律的逐一书面答复。