阿塞拜疆海关税以进口税为主，出口税为辅，出口税主要针对某些国内短缺的有色金属。进口税以从价税为主，分5个级差，最低0.5%、最高15%，中间有3%、5%、10%三个级差。另外对部分进口商品如水产品、汽车及其配件实行从量税。

除关税外海关还代征消费税和增值税。消费税从5%到90%不等，增值税为18%。