1、普通税率：适用于未与捷克签署政府间经贸协定的国家的进口商品，这类国家极少，如南极地区、西萨摩亚、不丹、安曼、西撒哈拉地区等等。

2、协议关税税率：指根据捷克与一些国家签署的政府间经贸协定的规定，相互提供最惠国待遇，对从这些国家进口的商品实行协议关税税率。

3、普惠制税率：指捷克单方面提供给发展中国家（包括中国）或较不发达国家和地区的普惠制待遇，这种关税分三种，即0%、50%和75%。

4、零关税税率：1993年10月，捷克政府颁布一项法律，对合资企业进口的用于深加工或组装最终产品的商品征收零关税，但前提条件是进口商品的价值须与在捷克加工成成品的出口商品的价值相同。具体规定如下：

（1）此项法律适用于外资比例不低于30%，或注入资本不低于5000万捷克克朗的合资企业。

（2）零关税不能自动启用。符合所有相关条件的进口商须向有关部门申请，获批准后方能享受。

（3）享受零关税的商品只能用于在捷克境内的加工生产。

（4）享受零关税的商品并不能免除海关规定的其它税收，如增值税等。

符合所有条件的新建合资企业，可在成立后一年内享受零关税，而且不需以出口来补偿进口。但是，享受零关税的进口商品额必须与同期内的生产总值相吻合。

海关估税制度