- 进出口商品均应被征收关税（吉布提不设单独关税，其关税实际上是指由海关代为收缴的国内消费税）、附加税或有关直接税。如进口商品来自与吉签订了优惠关税协定的国家和地区，可享受关税减免。

- 进出口商品应被运到设有间接税局办公室的地方或间接税局指定地点。只有经海关允许，货物才能在间接税局规定的地点和时间装卸。

- 间接税局允许持有货物通运保单的进出口商临时免交关税，保单持有人保证在规定时间内补纳应缴捐税。此类商品包括：将要转口或进入工业保税区或存入保税仓库的进出口商品；临时输出入的商品。

- 间接税局有权扣留假冒伪劣和不符合海关申报程序的进出口商品，开出扣留通知书，对扣压的商品可没收充公、拍卖或按一定比例分配。间接税局对偷漏税、拒不纳税或走私行为进行独立调查取证，并向吉法院一审法庭提起上诉。

（A）关税计征制度

吉布提的平均进口关税率为28％，包括国内消费税（TIC-5％至40％）、进口附加税（5％）、特别附加税（因商品不同而异）；出口无关税，仅对部分出口商品征收团结税或营业税（0至10％）。根据1999年财政预算的规定，吉对进口商品的征税作了一些调整，大致可分为：

- 免征关税的商品：不以营销为目的的电影片、书刊报纸、货币等；

- 鲜蔬菜水果、可食用植物（包括根、茎）等征收5吉郎/公斤；

- 一般生产和生活必需品：粮食作物（大米、小麦、高粱和玉米等），面粉、活动物家禽、草木花卉、食品工业废品、动物饲料、药品药剂、农用化肥征收5％-10％；

- 肉类（含动物内脏和肉类制成品）、海产品及其制成品、蛋奶制品、蔬菜水果制成品及罐头食品、动植物油、纺织品、衣服鞋类、建筑材料（如木材、水泥及用于建筑的矿产品等）和重型机械等征收20％；

- 绝大部分进口商品（包括卡特草、矿产品、化学和橡胶制品、皮革制品、纸张、轻工产品、家具和车辆船舶等）征收33％；

- 贵重金属和奢侈品（电子电器产品、首饰、艺术品等）征收40％。

吉对如下进口商品除征收国内消费税和进口附加税外，还加征特别附加税。特别附加税最高可达到商品原价值的160％，主要是针对某些品牌的酒类产品。另外进口卡特草除缴纳上述税外，还要被征收团结税和营业税。