﹛﹛伊朗海關中央總部由海關總長辦公室和四個副總關長辦公室組成，負責十個監管分支机构和德黑蘭各執行海關的管理和監督工作，而分布在全國各地的十個監管机构則對地方執行海關進行管理﹛邁赫爾阿巴德海關（MEHRABAD）﹛沙里亞爾海關（SHAHRIYAR）﹛西南海關（WEST ＆ SOUTH）和展覽及郵政海關的運行由德黑蘭中央總部直接管理﹛

﹛﹛伊朗全國共有141個執行海關，分布在德黑蘭和各大城鎮﹛邊境地區和一些波斯灣島嶼及邊境市場﹛

﹛﹛伊朗海關中央總部下設安全保障部﹛地區海關協調部﹛公共關系及國際關系部﹛調查部和爭端解決委員會，對監管机构和執行海關的工作進行指導和協調，根据情況，頒布或通告海關條例﹛指令和業已通過的法律﹛法規及其他必須遵照執行的措施，對執行海關提出的异議和問題進行調查并作出最終裁決﹛上述部門在海關總長的指導下進行工作﹛

﹛﹛四個副總關長分別下轄以下部門和辦公室：

﹛﹛1．海關事務副總關長：進口部﹛出口部﹛海關估价及關稅稅則部﹛

﹛﹛2．法律和監管事務副總關長：過境事務部﹛文件核審部﹛法律事務部﹛

﹛﹛3．行政和財政事務副總關長：服務及采購部﹛行政事務部﹛財政事務部﹛組織及預算部﹛