（1）強化了海關調查的權力和責任﹛根据修訂前﹛條例﹛的規定，侵權嫌疑貨物的收發貨人向海關提出异議后，海關不再對貨物是否构成侵權進行調查﹛這對海關打擊進出口環節的假冒和盜版案件十分不利﹛修訂后的﹛條例﹛則規定，無論收發貨人是否向海關提出异議，海關都可以對貨物的侵權狀況進行調查處理（涉嫌專利侵權的另有規定）﹛

（2）降低了對權利人申請海關保護提交擔保的要求﹛在﹛條例﹛修訂前，知識產權權利人要求海關扣留侵權嫌疑貨物，必須向海關提交相當于貨物价值的擔保金﹛這對經常遭受假冒和盜版侵害的權利人而言是一個十分沉重的經濟負擔﹛修訂后的﹛條例﹛放寬了對擔保的要求﹛規定今后海關在接受權利人申請時，可以根据貨物的侵權狀況決定收取不超過貨物价值的擔保金額，而且擔保的方式不再限制只能是擔保金一种方式，而是允許擴大到銀行保函等其他方式﹛

（3）取消了強制備案的要求﹛延長了備案的有效期﹛根据修訂后﹛條例﹛的規定，知識產權權利人請求海關扣留侵權嫌疑貨物的，只需要向侵權嫌疑貨物的進出境地海關提出申請，可以不再必須事先向海關總署辦理知識產權海關保護備案﹛同時還規定，知識產權海關保護備案的有效期從7年延長到10年﹛

（4）解決了有關机關之間在處理侵權爭議中的權力衝突問題﹛修訂后的﹛條例﹛取消了在知識產權主管部門或者人民法院處理侵權爭議期間海關仍然繼續扣留貨物以及貨物由海關依据知識產權主管部門的處理決定或者人民法院的判決處理的規定﹛縮短了貨物滯留口岸的時間，明确了法院司法管轄和海關行政處理的界限和銜接標准，減少了有關机關之間的權力衝突，更加便于人民法院審理案件﹛

（5）与世界貿易組織規則保持一致﹛根据世界貿易組織﹛与貿易有關的知識產權協議﹛的規定，海關應當允許收發貨人和知識產權權利人查看海關扣留的貨物，并且在貨物被确定為侵權后應當將貨物的有關情況通知權利人﹛所以，修訂后的﹛條例﹛增加了知識產權權利人可以查看有關貨物以及海關沒收侵犯知識產權貨物后應當將侵權貨物的情況書面通知知識產權權利人的規定﹛

（6）限制反擔保放行的适用范圍﹛根据修訂后﹛條例﹛，收發貨人在向海關提供擔保后申請放行侵權嫌疑貨物的權利只能适用涉嫌侵犯專利權的貨物﹛

（7）強化了海關對個人攜帶或者郵寄進出境的侵權物品的查處力度﹛