﹛﹛2000年12月7日，海關總署正式下文批准成立了重慶海關駐港口辦事處﹛但進出口報關的接單審核﹛計征稅費﹛放行結關等業務主要還集中在江北地區的重慶海關本部，而海關駐港口辦事處僅起監管和查驗作用，在這种通關体制下，重慶港九龍坡港區水運口岸通關效率相對低下﹛

﹛﹛隨著長江快速通關体系的建立，重慶海關根据九龍坡港區集裝箱吞吐量增長對海關快速通關業務的需求，提出了"通得快﹛管得住，為企業提供熱情周到的服務"的指導思想，海關駐港口辦事處建立了一套完整的作業程序﹛崗位職責和制度措施，使平均每票貨物的通關時間縮短為10分鐘，最快的通關放行時間僅5分鐘﹛業務發展到進出口轉關﹛接單審核﹛計征稅費﹛監管查驗﹛放行結關﹛理單統計﹛簽發出口退稅和進口結匯專用報關單﹛監管公共保稅倉庫貨物等全方位通關領域﹛目前，九龍坡港區水運進出口通關業務量已經占重慶關區（含机場﹛鐵路﹛公路﹛郵政﹛出口加工區﹛新港﹛涪陵﹛万洲）的80％以上﹛

﹛﹛隨著通關業務量的增加，去年5月1日，重慶海關駐港口辦事處率先在長江內河港口推出"5＋2"工作制﹛同時積极加強与成都海關，綿陽分關，成都海關瀘州辦事處﹛宜賓辦事處﹛自貢辦事處以及貴陽海關的聯系和協調，大力拓展二次轉關，促成了五梁液﹛四川聚酯﹛自貢塞迪維爾等項目的集裝箱在九龍坡港區中轉，据統計，今年1-9月九龍坡港區二次轉關集裝箱量達8200TEU﹛

﹛﹛港口与重慶海關建立數据接口，成為長江內河第一個港口与海關數据聯网管理的成功范例﹛港口通過集裝箱管理系統實時向海關提供貨物進出口和集裝箱進出場情況，然后海關根据接單和查驗情況直接向港口傳遞集裝箱（貨）放行信息﹛