檢察机關指控，在1997年3月到4月間，茹水泉利用職務便利，對首都机場海關查獲的台灣人廖繼仁﹛廖文炳和香港人蕭思平走私郵票一案，在移送公安机關偵查之前，私自發還3名港台人的台胞証﹛回鄉証使其离境，逃脫了刑事追究的責任﹛
起訴書還指控茹水泉犯有受賄罪：在1998年3月至6月間，茹水泉利用擔任北京海關調查局局長的職務便利，在和中郵大地郵票拍賣有限公司業務往來過程中，曾經收受了該公司經理封開萍送的1974年至1991年的紀念郵票﹛特种郵票集郵冊兩本，總价值人民幣4.9万余元﹛2000年3月，在有關部門向茹水泉調查情況時，他主動交代了上述受賄的事實﹛2002年3月22日
